El Gobierno Nacional expidió los decretos en los que se establece la nueva estructura organizacional de la Presidencia de la República, la nomenclatura, el régimen salarial, las funciones, así como la integración de las entidades adscritas.

Según el Gobierno Nacional, con estas acciones, se reducen 78 cargos en la entidad, que representan un ahorro en gastos de funcionamiento por $9.802​ millones por año y una reducción en gastos de inversión por $68 mil millones anuales. Con el rediseño, se pasa de 14 a 5 consejerías, se crea el cargo de Secretario General y jefatura de Despacho Presidencial con diferentes tareas.

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Las consejerías que se eliminan y pasan al nuevo ministerio de Igualdad y Equidad son la de la Mujer, Consejería de la Juventud. La Consejería de la Niñez y Adolescencia se elimina y sus funciones pasan al ICBF. La Consejería de Información y Prensa será fusionada con la Consejería de Comunicaciones. Otras consejerías que desaparecen son la de Seguridad Nacional, Competitividad y Atención al Migrante.

​Los documentos, suscritos por el Ministro de Hacienda, José Antonio Ocampo; el Director del Departamento Administrativo de la Presidencia de la República (DAPRE), Mauricio Lizcano, y el Director del Departamento Administrativo de la Función Pública, César Augusto Manrique, establecen que la estructura será la siguiente:

1. Despacho del Presidente de la República

2. Despacho de la Vicepresidenta de la República

2.1. Oficina de Despacho de la Vicepresidenta de la República

2.2. Consejería Presidencial para la Equidad de la Mujer

2.3. Dirección de Proyectos Especiales

3. Secretaría Jurídica

4. Jefatura de Despacho Presidencial

4.1. Casa Militar

4.2. Jefatura para la Protección Presidencial

4.3. Secretaría para las Comunicaciones y Prensa

4.4. Consejería Presidencial para las Regiones

5. Despacho del Director del Departamento / Secretaría General

5.1. Consejería Presidencial para la Reconciliación Nacional

5.2. Consejería Presidencial para los Derechos Humanos y el Derecho Internacional Humanitario

5.3. Consejería Presidencial para la Juventud - Colombia Joven

5.4. Oficina del Alto Comisionado para la Paz

5.4.1. Unidad de Implementación del Acuerdo Final para la Terminación del Conflicto y la Construcción de una Paz Estable y Duradera

5.5. Unidad de Cumplimiento

5.6. Secretaría de Transparencia

5.7. Oficina de Control Interno Disciplinario

5.8. Oficina de Relacionamiento con el Ciudadano

5.9. Subdirección General

5.9.1. Dirección Administrativa y Financiera

5.9.1.1. Área Administrativa

5.9.1.2. Área de Contratos

5.9.1.3. Área Financiera

5.9.2. Oficina de Planeación

5.9.3. Oficina de Talento Humano

5.9.4. Oficina de Tecnologías y Sistemas de Información

5.9.5. Oficina de Control Interno

6. Órganos de Asesoría y Coordinación

6.1. Comité de Coordinación del Sistema de Control Interno

6.2. Comisión de Personal

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De igual manera, en los decretos se establecen las entidades adscritas al Departamento Administrativo de la Presidencia de la República, como la Unidad Nacional para la Gestión del Riesgo de Desastres (UNGRD), la Agencia para la Reincorporación y la Normalización, la Agencia para la Renovación del Territorio, la Agencia Presidencial de Cooperación Internacional de Colombia – APC COLOMBIA y la Agencia Nacional Inmobiliaria Virgilio Barco Vargas.